Molekulāri bioloģiskās laboratoriskās tehnoloģijas

Nr.p.k.

Testēšanas objekts

Izmeklējamais rādītājs

Izmeklēšanas metode, princips

Tehnoloģijas kods

1.

Asins serums

B hepatīta DNS

DNS hibridizācijas metode

La/ MoB 001

2.

Asins plazma

B hepatīta DNS

DNS hibridizācijas metode

La/ MoB 002

3.

Asins serums

C hepatīta vīrusa RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 003

4.

Asins plazma

C hepatīta vīrusa RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 004

5.

Asins serums

C hepatīta vīrusa RNS, kvantitatīvi

Kvantitatīva polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 005

6.

Asins plazma

C hepatīta vīrusa RNS, kvantitatīvi

Kvantitatīva polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 006

7.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Chlamidia trachomatis antigēns

Ligāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 007

8.

Biopsijas un sekcijas materiāli

Chlamidia trachomatis antigēns

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 008

9.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Chlamidia trachomatis DNS

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 009

10.

Urīns

Chlamidia trachomatis DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 010

11.

Urīns

Chlamidia trachomatis DNS

Ligāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 011

12.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Chlamidia trachomatis DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 012

13.

Uztriepe no dzimum-orgāniem

Chlamydia trachomatis ribosomālās RNS

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 013

14.

Asins plazma ar antikoagulantu EDTA

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 014

15.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 015

16.

Muguras smadzeņu šķidrums

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 016

17.

Biopsijas un sekcijas materiāli

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 017

18.

Urīns

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 018

19.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

FRAXA lokusa mutācija

Polimerāzes ķēdes reakcija+elektro-forēze

La/ MoB 019

20.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

G 272X

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)+restrikcijas analīze+elektro-forēze

La/ MoB 020

21.

Asins plazma ar antikoagulantu EDTA

Herpes simplex vīrusu 1., 2. tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 021

22.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Herpes simplex vīrusu I, II tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 022

23.

Muguras smadzeņu šķidrums

Herpes simplex vīrusu I, II tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 023

24.

Biopsijas un sekcijas materiāli

Herpes simplex vīrusu I, II tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 024

25.

Asins plazma ar anti-koagulantu EDTA

HIV 1 vīrusa RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 025

26.

Asins plazma ar antikoagulantu EDTA

HIV 1 vīrusa RNS, kvantitatīvi (vīrusa slodze)

Kvantitatīva polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 026

27.

Asinis ar anti-koagulantu

HLA - B27 antigēna noteikšana

Polimerāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 027

28.

Asinis ar anti-koagulantu

HLA I un II klases antigēnu tipēšana

Polimerāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 028

29.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

IV 10 nt 546

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)+restrikcijas analīze+elektro-forēze

La/ MoB 029

30.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

K 329 E

Polimerāzes ķēdes reakcija 1, polimerāzes ķēdes reakcija 2  D17+ elektroforēze

La/ MoB 030

31.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Mycoplasma hominis DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 031

32.

Uztriepe no dzimum-orgāniem

Neisseria gonorrhoeae mērķa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 032

33.

Urīns

Neisseria gonorrhoeae mērķa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 033

34.

Uztriepe no dzimum-orgāniem

Neisseria gonorrhoeae mērķa DNS

Ligāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 034

35.

Urīns

Neisseria gonorrhoeae mērķa DNS

Ligāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 035

36.

Uztriepe no dzimum-orgāniem

Neisseria gonorrhoeae mērķa RNS

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 036

37.

Uztriepe no dzimum-orgāniem

Neisseriae gonorrhoeae ribosomālās RNS

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 037

38.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Papillomas vīrusi

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 038

39.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimum-orgānu) un nokasījumi

Papillomas vīrusu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 039

40.

Biopsijas un sekcijas materiāli

Papillomas vīrusu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 040

41.

Biopsijas un sekcijas materiāli

Papillomas vīrusu DNS

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 041

42.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

R 252 W

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)+restrikcijas analīze+elektro-forēze

La/ MoB 042

43.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

R 261 Q

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)+restrikcijas analīze+elektro-forēze

La/ MoB 043

44.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

R 408 W

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)+restrikcijas analīze+elektro-forēze

La/ MoB 044

45.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimum-orgānu) un nokasījumi

Ureaplasma urealyticum DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 045

46.

DNS

Gēnu mutāciju selektīvais skrīnings

Polimerāzes ķēdes reakcija, elektrofoēze

La/ MoB 046

47.

DNS

SMA gēna mutāciju noteikšana

Polimerāzes ķēdes reakcija, elektrofoēze

La/ MoB 047

48.

DNS

Fragilā X sindroma mutāciju noteikšana

Sauzerna blotings, izmantojot neradiaktīvas iezīmes

La/ MoB 048

49.

DNS

VNTR sistēma FAH gēna

VNTR (minisatelītu) sistēmas analīze ar polimerāzes ķēdes reakciju (elektroforāzi)

La/ MoB 049

50.

DNS

STR sistēmu FAH gēnā

STR (minisatelītu) sistēmas analīze ar polimerāzes ķēdes reakciju (elektroforāzi)

La/ MoB 050

51.

DNS

Y hromosomas delēcijas

Y hromosomas delēciju noteikšana (Promega System, Version 1.1) ar polimerāzes ķēdes reakciju (elektroforēze)

La/ MoB 051

52.

DNS

Paternitātes noteikšana

GenePrint®Silver STR®III sistēma ar polimerāzes ķēdes reakciju (elektroforēze)

La/ MoB 052

53.

Bioloģiskais materiāls

Citomegalovīrusa DNS

DNS hibridizācijas metode

La/ MoB 053

54.

Bioloģiskais materiāls

Herpes simplex vīrusa DNS

DNS hibridizācijas metode

La/ MoB 054

55.

Bioloģiskais materiāls

Varicella zoster vīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 055

56.

Bioloģiskais materiāls

Epšteina - Barra vīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 056

57.

Bioloģiskais materiāls

Enterovīrusu RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 057

58.

Bioloģiskais materiāls

JC vīrusu (Polyomavirus) DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 058

59.

Bioloģiskais materiāls

6.tipa cilvēka Herpesvīrusa (HHV-6) DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 059

60.

Bioloģiskais materiāls

Toxoplazma gondii DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 060

61.

Bioloģiskais materiāls

C. diphtheriae RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 061

62.

Bioloģiskais materiāls

Cryptococcus neoformans DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 062

63.

Bioloģiskais materiāls

Borrelia burgdorferi DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 063

64.

Bioloģiskais materiāls

HIV 1 vīrusa RNS

Ligāzes ķēdes reakcija (LCR)

La/ MoB 064

65.

Bioloģiskais materiāls

HIV genotips

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR) + lineāra imūnfermentatīva reakcija (LIA)

La/ MoB 065

66.

Asins plazma

C hepatīta vīrusa DNS genotipēšana (HCV genotipēšana)

Polimerāzes ķēdes reakcija un imunoblots (PCR, imunoblots)

La/ MoB 066

67.

Asins serums

C hepatīta vīrusa DNS genotipēšana (HCV genotipēšana)

Polimerāzes ķēdes reakcija un imunoblots (PCR, imunoblots)

La/ MoB 067

68.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

STR (īsie fragmentu atkārtojumi) genotips Paternitātes un personas identifikācijas noteikšana

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS fragmentu
analīze ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 310 izmantojot reaģentu komplektu AmpFISTR®
Identifiler™

La/ MoB 068

69.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

Mutāciju klātbūtne gēnā F8
Hemofīlijas A DNS diagnostika

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS sekvenēšana
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 069

70.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

Mutāciju klātbūtne gēnā F9
Hemofīlijas B DNS diagnostika

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS sekvenēšana
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 070

71.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

4 mutāciju klātbūtne gēnā BRCA1: 5382insC, 185delAG, 300T>G, 4154delA
Iedzimta krūts un olnīcu vēža DNS diagnostika

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS fragmentu analīze, DNS sekvenēšana 
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 071

72.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

Mutācijas C(677)T klātbūtne gēnā MTHFR(metilēn-tetrahidrofolāta reduktāze)
Trombofilijas DNS diagnostika: MTHFR DNS tests

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS sekvenēšana
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 072

73.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

Mutācijas G(20210)A klātbūtne gēnā F2
Trombofilijas DNS diagnostika: protrombīna DNS tests

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS sekvenēšana
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 073

74.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

Mutācijas G(1691)A klātbūtne gēnā F5
Faktora V Leidena trombofilijas DNS diagnostika

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS sekvenēšana
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 074

75.

Perifēriskās asinis, kaulu smadzenes

Filadelfijas (Ph) hromosomas noteikšana. (Filadelfijas hromosoma -bcr/abl translokācija starp 9. un 22. hromosomu)

Ph (Filadelfijas) hromosomas kvalitatīvā noteikšana, izmantojot RT-divpakāpju PCR. Reversās transkriptāzes polimerāzes ķēdes reakcija (RT-PCR), DNS fragmentu analīze, BCR-ABL mRNS detektēšana.
MT 10-011

La/ MoB 075

76.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

CFTR gēna mutācija dF508

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

 La/ MoB 076

77.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

CFTR gēna mutācija del394TT

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 077

78.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

SERPINA1 gēna mutācija PI Z

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi

La/ MoB 078

79.

DNS

SERPINA1 gēna mutācija PI S

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi

La/ MoB 079

80.

DNS

CX26 gēna mutācija del35G

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi (RE)

La/ MoB 080

81.

DNS

UGT1A1 gēna genotips (TA)7/(TA)7

PCR, Denaturējošā gela elektroforēze (DGE)

La/ MoB 081

82.

DNS

HFE gēna mutācija C282Y

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi (RE)

La/ MoB 082

83.

DNS

HFE gēna mutācija H63D

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi (RE)

La/ MoB 083

84.

DNS

HFE gēna mutācija S65C

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi (RE)

La/ MoB 084

85.

DNS

TFR2 gēna mutācija Y250

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi (RE)

La/ MoB 085

86.

 Asinis

 DNS fragmenti

Polimerāzes ķēdes reakcija (DNS fragmentu kopiju skaita pavairošana)

La/MoB 086

87.

Perifēriskās asinis, siekalas, audi.

Donora šūnu % daudzums  recipienta asinīs

Himērisma monitorings pēc alogēnas kaulu smadzeņu vai perifērisko asiņu cilmes šūnu transplantācijas, izmantojot STR lokusu genotipēšanu. PCR, izmantojot specifiskus praimerus; DNS fragmentu analīze ar kapilāro elektroforēzi; datorizēta rezultātu apstrāde – donora/recipienta informatīvo lokusu pīķu laukumu salīdzināšana. (07-003)

La/ MoB 087

88.

Augļūdens, horija bārkstiņu bioptāts,  perifēriskās asinis, siekalas.

13., 18., 21. un dzimumhromosomu aneiploīdija cilvēka šūnās

Biežāko hromosomu patoloģiju prenatālā diagnostika, izmantojot reaģentu komplektu ChromoQuantTM . PCR, izmantojot specifiskus praimerus; DNS fragmentu analīze ar kapilāro elektroforēzi; datorizēta rezultātu apstrāde – informatīvo lokusu pīķu laukumu proporciju noteikšana. (07-004)  

La/ MoB 088

89.

Perifēriskās asinis, kaulu smadzenes

Hibrīdās BCR-ABL mRNS daudzums attiecībā pret veselās BCR un/vai ABL mRNS daudzumu.

Ph (Filadelfijas) hromosomas pozitīvu leikožu terapijas efektivitātes kontrole, izmantojot BCR/ABL gēna ekspresijas kvantitatīvu analīzi. mRNS izolēšana; kDNS sintēze; reālā laika PĶR (qPCR) ar amplifikācijas produktu daudzuma pieauguma novērošanu pēc katra amplifikācijas cikla, izmantojot produktam specifisku fluorescenti iezīmētu oligonukleotīdu zondi.
MT 10-010

La/ MoB 089

 

90.

Asins serums, plazma

Hepatīta B  vīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PĶR) HBV DNS noteikšanai MT 09- 052

La/MoB 90

91.

Bioloģiskais materiāls

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) CMV DNS noteikšanai

MT 09- 053

La/ MoB 91

 92.

Bioloģiskais materiāls

Herpes simplex vīrusu 1 un 2 tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) HSV ½ DNS noteikšanai

MT 09- 054

La/ MoB 92

93.

Bioloģiskais materiāls

Varicella zoster vīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) VZV DNS noteikšanai

MT 09- 055

La/ MoB 93

94.

Bioloģiskais materiāls

Epšteina - Barra vīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) EBV kvantitatīvai DNS noteikšanai MT 09- 056

La/ MoB 94

95.

Bioloģiskais materiāls

Enterovīrusu RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) enterovīrusu  RNS noteikšanai MT 09- 057

La/ MoB 95

96.

Bioloģiskais materiāls

A/B gripas vīrusu RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) A/B gripas vīrusu RNS noteikšanai MT 09- 058

La/ MoB 96

97.

Bioloģiskais materiāls

A gripas vīrusu subtipi

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) A gripas vīrusu subtipu noteikšanai

MT 09- 059

La/ MoB 97

98.

Asins plazma

HIV genotips

Sekvenēšana HIV genotipa noteikšanai

 DNS sekvenēšana

MT 09- 060

La/ MoB 98

99.

Asins leikocīti, augļa ūdens

Citomegalovīrusa DNS 

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR) CMV DNS noteikšanai MT 09- 061

La/MoB 99

100.

Asins leikocīti, augļa ūdens

Herpes simplex vīrusu 1 un 2 tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR) HSV 1/2 noteikšanai  MT 09- 062

La/MoB 100

101.

Izkarnījumi

Norovīrusu 1,2 tipa RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR) Norovīrusu ½ tipa RNS noteikšanai

 MT 09- 063

La/MoB 101